自杂交种制种成功，并大面积得到推广后，人们发现杂交作物有着很高的丰产性状和抗逆性状，于是不少人便将杂交种后代自留种子。可是当自留的种子种下后却发现，后代作物的表现和产量等大不如其上代作物，从而造成不小的经济损失，这却是为何呢？
原来我们购买的杂交种是由两个（或三个）不同的“品种（或稳定材料）”配组杂交而得第一代杂交种，其兼有两个（或三个）品种的优点，且遗传基础一致，所以种下后作物的生长和产量表现都比较优良。但我们收获的杂种一代作物的种子（第二代杂交种子），其遗传背景就比较复杂了，原因是杂种一代作物的生殖细胞已经开始分离，分别偏向它的父母，且此时授粉方式是相互授粉，所以杂种二代种子的遗传基础就会分离向父本、母本、杂种、以及一些变异。由这样的种子生长出来的作物，其表现也就不言而喻了。因此，杂交种不能留种，要年年配种，年年利用第一代杂交种，才能起到增产的作用。
农民朋友切不可将杂交种后代自行留作种用，那样会有极大的风险导致经济损失，因此，要获得理想的作物收益，请广大农民朋友前往种子市场挑选购买正规厂家生产的杂交一代种子，切不可贪图便宜购买来源不明或者小作坊私繁私售的劣质种子。